Proces- en sociale innovaties zijn belangrijk om het HWBP beter en efficiënter uit te voeren. Daarom voeren de waterschappen projecten uit die de strategie en de aanpak van projecten verbeteren. Of die de ruimte van de overstromingskansbenadering benutten. Voorbeelden zijn Systems Engineering (HEEL), de aanpak van kunstwerken (Samenwerking Kunstwerken), De Innovatieversneller, Dijken en Natuur en Waterveiligheidslandschappen.